抗生素漤用，造成不少患者感染某些細菌后，無法妥善治療。專家表示，以會引發院內感染的鮑氏不動桿菌來說，容易引起肺炎、菌血癥等，屬于幾乎無藥可用的細菌；社區常見的大腸桿菌或克萊白氏菌，容易引發泌尿道感染，也對頭孢子素等抗生素產生抗藥性。

小兒感染科主任黃立民表示，國內大腸桿菌抗藥性問題比美國嚴重，且早在多年前就已出現此現象。

醫師郭書辰表示，鮑氏不動桿菌容易引起肺炎、菌血癥，治療這類的細菌要反覆使用抗生素，也讓細菌“被訓練得很強悍“；之前八仙塵爆大量傷者住院就醫，就因為沒有皮膚組織保護，有不少人感染這類病菌，且幾乎無抗生素可用。

此外，郭書辰說，社區常見的大腸桿菌，很可能引發泌尿道感染，出現頻尿、發燒癥狀，對第一代頭孢子類抗生素抗藥性達50%；另一種社區常見、會引起泌尿島感染及腹腔內感染的克萊白氏菌，對第一代頭孢子素也有30%抗藥性。

會造成皮膚感染，甚至嚴重會引起蜂窩性組織炎的金黃色葡萄球菌，也對oxaccillin抗生素有50%抗藥性，對克琳達霉素也有35%抗藥性。

郭書辰解釋，社區中會產生這么多的抗藥性，影響原因很多，可能是民眾將藥帶回家后，沒有持續服用、或經常亂吃抗生素等原因所引發。