在3月31日于首波上市國家開放銷售的iPhone SE，稍早已經由iFixit、ChipWorks等網站完成拆解，其中發現有不少零件確實與iPhone 5s共用，例如采用相同螢幕面板模組、維持使用Toshiba提供NAND Flash儲存元件，同時機身框體也大致相同。不過，iPhone SE采用較大的電池容量，同時內部電池接點、相機模組設計均不同，因此無法直接與iPhone 5s互換使用。

根據iFixit、ChipWorks等網站完成iPhone SE拆解報導內容，顯示此款新機在不少細節仍與iPhone 5s相同，例如均采用相同螢幕面板模組、相同的Toshiba NAND Flash儲存元件，同時金屬機身框體也幾乎完全相同。

不過，iPhone SE可能因為相機功能與加入NFC感應功能，因此電池容量采用1624mAh設計，相比iPhone 5s采用1560mAh容量設計稍大一些。但因為電池接點設計不同，因此iPhone SE采用電池元件無法直接用于iPhone 5s。

至于iPhone SE所采用1200萬像素相機，同樣因為模組設計與接點差異緣故，因此無法用在iPhone 5s上，但也因為接點差異緣故，因此iPhone SE所采用相機模組與iPhone 6s系列機種設計也無法直接互換使用。

而先前傳出可能采用Intel LTE通訊模組的說法，在此次拆解內容中也證實仍采用Qualcomm提供元件，但僅采用舊款通訊模組，亦即與iPhone 5s相同設計，下載速度最高僅達LTE Advanced規格，亦即150Mbps。